À Coordenação Acadêmica compete dar apoio aos estudantes com dificuldades para progredirem no curso de forma satisfatória. Age em parceria com o Serviço de Graduação, setor este que gere os assuntos acadêmicos estudantis e é subordinado à Comissão de Graduação da FMUSP. É coordenada pelas Profa. Dra. Marisa Dolhnikoff, do Departamento de Patologia (e-mail tutoria.academica@fm.usp.br) e Profa. Dra. Carla Gentile Matas, do Departamento de Fisioterapia, Fonoaudiologia e Terapia Ocupacional, que atende pelo telefone (11) 3091-8411 ou e-mail cgmatas@usp.br.